El proyecto de construcción de una nueva depuradora en Can Picafort ha estado rodeado de polémica desde el primer momento. Por una parte, el ayuntamiento de Santa Margalida se ha manifestado en numerosas ocasiones en contra al considerar que sería suficiente una reconversión de la actual depuradora de la Platja de Muro que da servicio a la costa de este municipio y también al núcleo de Can Picafort. El Consistorio 'vilero' denuncia que la infraestructura, y principalmente el emisario previsto en Son Bauló, provocarán un gran impacto medioambiental. El Ayuntamiento ha remitido alegaciones en las que insta a reducir dos lagunas de la actual depuradora para ampliar el sistema de depuración convencional.
Por otra parte, el ayuntamiento de Muro está totalmente a favor de que Can Picafort cuente con su propia estación de saneamiento para reducir presión a la actual depuradora de la Platja de Muro.
