El sistema informático implantado para el nuevo hospital es el blanco común de buena parte de las criticas sindicales. "La docencia de este programa informático comenzó en el mes de agosto y, hoy en día, no está desarrollado para funcionar ni en la UCI general ni en la pediátrica, así como tampoco en Reanimación. Y que se caiga un programa informático en la UCI es muy grave", denunció Lázaro, que recalcó que el programa Millennium puede ser bueno para los hospitales privados norteamericanos, pero no tiene sentido en el ámbito de la sanidad pública europea. El representante del Sindicato Médico recordó que este programa por el que ha optado finalmente la Conselleria fue el peor puntuado por el comité de médicos asesores. Juan Jesús Fernández, del SATSE, aseguró que en Consultas Externas no pueden citar a los pacientes con el Millennium, pese a que el traslado de esta actividad está previsto que comience el lunes de la próxima semana.